SCP to anomalie, które zostały złapane przez Fundację. Są one przechowywane w licznych placówkach należących do Fundacji na całym świecie, takich jak Site-88, Site-17 i Site-02, z których ta ostatnia jest miejscem akcji SCP: Secret Laboratory. Niektóre anomalie mogą być szkodliwe lub wrogie, a inne, jeżeli zostaną użyte w odpowiedni sposób, mogą być bardzo użyteczne. Poniżej znajdziesz listę dostępnych podmiotów SCP w grze.